La Conferencia de las Partes podrá invitar a asociarse al Instituto a Estados externos a la región y a organismos intergubernamentales regionales o internacionales, así como a las industrias y otras organizaciones no gubernamentales y privadas interesadas en apoyar la Agenda Científica y las actividades programáticas del Instituto.
Los asociados del Instituto son:
- AAAS American Association for the Advancement of Science / Asociación Estadounidense para el Avance de la Ciencia
- CIESIN Center for International Earth Science Information Network / Centro para la Red Internacional de Información sobre Ciencias de la Tierra
- CR2 Center for Climate and Resilience Research / Centro para la Investigación del Clima y la Resiliencia
- FAPESC Fundação de Amparo à Pesquisa e Inovação do Estado de Santa Catarina / Fundación de Apoyo a la Investigación Científica del Estado de Santa Catarina
- FAPESP Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo / Fundación de Apoyo a la Investigación Científica del Estado de São Paulo
- Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt
- Mitacs
- Future Earth
- Estación COIBA AIP
- STRI Smithsonian Tropical Research Institute
- Universidad de las Indias Occidentales
- Research Center for Global Environmental Change (CICAG), Exact and Natural Science School, National University of Asunción



